Ayhan Bilgen, 1970 yılında Kars'ta doğdu.
Ankara Üniversitesi Siyasal Bilgiler Fakültesi Kamu Yönetimi'nden mezun olduktan sonra Hacettepe Üniversitesi Sosyoloji Bölümünde yüksek lisans yaptı.
Özgür Gündem ve Evrensel Gazetesi'nde köşe yazarlığı yaptı.
7 Haziran 2015 seçimlerinde HDP Kars Milletvekili seçildi.
HDP'nin ilk parti sözcüsü oldu.
TBMM 26. Dönem TBMM İnsan Haklarını İnceleme Komisyonu Katip Üyesidir.
Ayhan Bilgen hakkında, 'Suç işlemeye alenen tahrik' ve 'Halkı kanuna aykırı toplantı ve gösteri yürüyüşüne kışkırtma' suçlarından 11 yıldan 25 yıla kadar hapisle cezalandırılması istendi.