Baki Kaya, 1986 yılında Kara Harp Okulu'ndan, 1987 yılında Topçu ve Füze Okulu'ndan mezun oldu.
Değişik kıtalarda yerölçme takım komutanlığı, batarya subaylığı ve batarya komutanlığı yaptı. 1995-1996 yıllarında Bosna-Hersek Türk Tugayında İstihbarat Kısım Amiri; 1999 yılında Kara Harp Akademisi'nden, 2001 yılında Pakistan Kara Kurmay Komuta Koleji'nden mezun oldu. 2003-2006 yılları arasında JFC Brunsum/Hollanda'da 2 yıl süreyle Eğitim Tatbikat Başkanlığı'nda proje subaylığı, 1 yıl süreyle Cari İstihbarat Şube Müdürlüğü yaptı.
Genelkurmay İletişim Dairesi, Kara Harp Okulu ve Kara Kuvvetleri Eğitim Doktrin Komutanlığı'nda görev yaptı ve 2010 yılında kendi isteğiyle emekli oldu.
