Cengiz Tomar 1970 yılında Üsküdar'da doğdu. İlköğrenimini Çengelköy Mehmetçik ve Kuleli Emek İlkokulu'nda tamamladı. 1988 yılında Üsküdar İmam-Hatip Lisesi'nden mezun oldu. Aynı yıl kaydolduğu Marmara Üniversitesi Fen-Edebiyat Fakültesi Tarih Bölümü'nden 1992 yılında lisans derecesi aldı.
1993 yılında Marmara Üniversitesi, Tarih Bölümü'nün araştırma görevlisi kadrosuna atandı. 1996 yılında yüksek lisans ve 2006 yılında doktora eğitimini Marmara Üniversitesi, Türkiyat Araştırmaları Enstitüsü, Ortaçağ Tarihi bilim dalında Memlük tarihi alanında tamamladı. 1993-1995 yılları arasında Ürdün Üniversitesi'nde Arapça ve İslam tarihi, 1996-1997 tarihleri arasında Ortadoğu Teknik Üniversitesi'nde İngilizce eğitimi aldı. 2000-2003 yılları arasında Edinburgh Üniversitesi, İslam ve Ortadoğu Araştırmaları bölümünde Ortadoğu tarihi alanında çalıştı. 2003-2005 yıllarında Şam Üniversitesi'nde öğretim üyesi görev yaptı. 2011 yılında doçent oldu. 2011-2014 yılları arasında M.Ü. Ortadoğu Araştırmaları Enstitüsü'nde müdür yardımcısı ve Ortadoğu Siyasi Tarihi ve Uluslararası İlişkiler Anabilim dalı başkanı olarak görev yaptı. 2016 yılında profesör unvanını aldı.
1998-2017 tarihleri arasında Türkiye Diyanet Vakfı, İslam Ansiklopedisi, İslam Tarihi İlim Heyeti üyesi, 2007-2017 yıllarında İslam İşbirliği Teşkilatı, İslam Tarihi Sanat ve Kültür Merkezi'nde (IRCICA) araştırma ve yayınlar bölüm başkanı olarak çalıştı. Ortadoğu ve Arap coğrafyasının tarihi ve kültürüne dair pek çok çalışması bulunan Prof. Dr. Cengiz Tomar, 2017 yılında Yalova Üniversitesi Rektör Yardımcılığı görevine atandı.
Cengiz Tomar evli ve iki çocuk babası.