Hakkı Atun 1935 yılında Mağusa'nın Ergazi Köyünde doğdu. 1959'da İstanbul Teknik Üniversitesi'nden yüksek mühendis mimar olarak mezun oldu. Manchester ve Nottingham Üniversitelerinde kent planlama ihtisası yaptı. 1961-1975 yıllarında çeşitli kamu görevlerinde bulundu.1963 yılında Limasol-Baf Planlama Bölge Müdürü, 1967'de Planlama İnşaat Dairesi Müdürü, 1975'de İskan Müsteşarı oldu.
1976, 1981, 1985, 1990 Genel Seçimlerinde Ulusal Birlik Partisinden Lefkoşa Milletvekili seçildi ve bu dönemde İskan ve Rehabilitasyon Bakanlığı, Ekonomi ve Maliye Bakanlığı ve Milli Eğitim Kültür Gençlik ve Spor Bakanlığı ve Ulusal Birlik Partisi Genel Sekreterliği görevlerinde bulundu. 1983 yılında oluşturulan Kurucu Mecliste üyelik yaptı ve kurulan ilk Cumhuriyet Hükümetinde İskan Bakanlığı yaptı. 1985-1993 yıllarında Meclis Başkanlığı görevini yürüttü.
1992'de, Ulusal Birlik Partisi içinde, 9 Milletvekili ile önderliğini yaptığı hareketin sonucunda kurulan Demokrat Partinin Başkanlığına seçildi. 1993 Erken Genel Seçimlerinde Demokrat Partiden Lefkoşa Milletvekili seçildi ve kurduğu Demokrat Parti-Cumhuriyetçi Türk Partisi Koalisyon Hükümetlerinde 16 Ağustos 1996 tarihine kadar Başbakan olarak görev yaptı. 4 Ekim 1996 tarihinde yeniden Cumhuriyet Meclisi Başkanlığına seçildi.
Daha sonra mecliste yer almadı. İngilizce ve az derecede Rumca bilen Hakkı Atun DP'nin Onursal Başkalığı görevine devam ediyor. Atun evli ve iki çocuk babası.